MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-1 DNA

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020820	GTT	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020820	CCT	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020820	TTA	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020820	A	6	6	2719	2724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020820	ACTA	2	8	4256	4263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020820	AT	3	6	4361	4366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020820	TCA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020820	CCT	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020820	GT	3	6	5335	5340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020820	CTT	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020820	CAA	3	9	5623	5631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020820	TCA	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020820	TA	3	6	5657	5662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020820	T	6	6	5672	5677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020820	TCC	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020820	CTT	2	6	7253	7258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020820	CTCC	2	8	7335	7342	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_020820	AAC	2	6	7371	7376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020820	TGA	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020820	TAA	2	6	7400	7405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020820	CTT	2	6	7422	7427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020820	TCC	2	6	8890	8895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020820	CCT	2	6	15457	15462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020820	ATT	2	6	15531	15536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020820	AGG	2	6	15537	15542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020820	CTG	2	6	15594	15599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020820	T	7	7	15614	15620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020820	GTTT	2	8	15621	15628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020820	AATT	2	8	15656	15663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020820	TTC	2	6	15689	15694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020820	GCC	2	6	15712	15717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020820	GATC	2	8	15738	15745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020820	AAT	2	6	15824	15829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020820	AC	3	6	15854	15859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020820	TGT	2	6	17987	17992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020820	CTG	2	6	18086	18091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020820	TCA	2	6	18144	18149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020820	ATT	2	6	18187	18192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020820	GTT	2	6	18936	18941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020820	T	7	7	19392	19398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020820	AG	3	6	20673	20678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020820	TACAA	2	10	20702	20711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020820	T	6	6	20810	20815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020820	AAC	2	6	20823	20828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020820	A	6	6	20829	20834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020820	AGT	2	6	20996	21001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020820	GTT	2	6	21086	21091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020820	AATT	2	8	21093	21100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020820	AGA	2	6	21185	21190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020820	A	6	6	21404	21409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020820	T	6	6	21429	21434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020820	GCAA	2	8	21477	21484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020820	AAC	2	6	21512	21517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020820	C	6	6	21519	21524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_020820	T	6	6	21543	21548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020820	TGCG	2	8	21616	21623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020820	CTGTT	2	10	21713	21722	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020820	T	7	7	21726	21732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020820	T	6	6	21741	21746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020820	TCC	2	6	21782	21787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_020820	CTC	2	6	22647	22652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020820	TAAG	2	8	22661	22668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020820	TAA	2	6	22671	22676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020820	ATA	2	6	22691	22696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020820	ATA	2	6	22701	22706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020820	ATG	2	6	22720	22725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020820	ATT	2	6	22746	22751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020820	TA	3	6	22754	22759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020820	A	6	6	22822	22827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020820	CGAA	2	8	22905	22912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020820	CAA	2	6	22985	22990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020820	A	6	6	23105	23110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020820	TC	3	6	24447	24452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020820	CTTA	2	8	24453	24460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020820	A	6	6	24508	24513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020820	ATTA	2	8	24551	24558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020820	TAAT	2	8	24582	24589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020820	TTA	2	6	24726	24731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020820	CGT	2	6	24739	24744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020820	CAAAA	2	10	24747	24756	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020820	AGC	2	6	24804	24809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020820	ACA	2	6	24930	24935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020820	CTTG	2	8	24956	24963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020820	TTA	2	6	25008	25013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020820	AAGATT	2	12	25078	25089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020820	AT	3	6	25127	25132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020820	TAT	2	6	25211	25216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020820	CAC	2	6	28244	28249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_020820	GTTG	2	8	30133	30140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020820	TAGA	2	8	30153	30160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020820	TCA	2	6	30170	30175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020820	CATT	2	8	30189	30196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020820	AT	3	6	30231	30236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020820	TGCT	2	8	30287	30294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020820	ATA	2	6	30427	30432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020820	TAGG	2	8	30502	30509	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020820	CAA	2	6	30539	30544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020820	ATT	2	6	30615	30620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020820	TTTG	2	8	30651	30658	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020820	GT	3	6	30709	30714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020820	TAG	2	6	30778	30783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020820	GGA	2	6	30795	30800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020820	TAA	2	6	34687	34692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020820	TAAA	2	8	34699	34706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020820	ACT	2	6	34735	34740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020820	GCAA	2	8	34758	34765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020820	ATA	2	6	34784	34789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020820	GTA	2	6	34853	34858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020820	ATTC	2	8	34902	34909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020820	T	6	6	34931	34936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020820	TG	3	6	34951	34956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020820	AGA	2	6	34981	34986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020820	TGA	2	6	35304	35309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020820	TGT	2	6	35327	35332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020820	CTA	2	6	35337	35342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020820	ATG	2	6	35344	35349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020820	GTA	2	6	35409	35414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020820	CTA	2	6	35490	35495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020820	AT	3	6	35575	35580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020820	G	9	9	35588	35596	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020820	GT	3	6	35651	35656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020820	TAA	2	6	35889	35894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020820	TAA	2	6	40441	40446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020820	AAG	2	6	40745	40750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020820	TGAGG	2	10	40781	40790	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020820	AAT	2	6	40806	40811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020820	CAA	2	6	40914	40919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020820	A	7	7	40922	40928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020820	GCC	2	6	40929	40934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020820	GAC	2	6	40961	40966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020820	CTT	2	6	41037	41042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020820	T	6	6	41041	41046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.